Yibuti se encuentra en el este de África, bordeando el golfo de Adén y el mar Rojo entre Eritrea y Somalia. Su territorio ocupa una superficie de 23.200 km², un área similar a la de la Comunidad Valenciana.
El centro del país es montañoso y divide a Yibuti en la llanura costera y una meseta en el interior. El punto más bajo es el lago Assal (-155 metros), y el más alto es Moussa Ali (2.028 metros). Los recursos naturales de Yibuti incluyen la energía geotérmica.
No existen superficies de tierra arable, irrigación o cosechas permanentes, ni clase alguna de bosque. El 9% del país forma parte de tierras de pastoreo permanente. El clima es desértico con temperaturas medias de 30°C.
El suministro inadecuado de agua potable y la desertificación son problemas actuales. Yibuti forma parte de los acuerdos internacionales sobre biodiversidad, cambio climático, desertificación, especies en peligro, Derecho del Mar, Protección de la Capa de Ozono.
